i-COX2 v1.0
insilico_COX-2_v1.0. Investasi (berlisensi untuk kegiatan akademik/riset): Rp. 500.000,00 (di luar ongkos kirim).
Berupa 4 GB USB flashdrive merk Transcend teristall OS Ubuntu 10.04 terkustomisasi. Diperuntukkan PC/Laptop yang bisa boot via USB.
Kustomisasi:
- Terinstal OpenBabel
- Terinstal BKChem
- Terinstal PLANTS1.1 dan SPORES (pengguna harus meregistrasikan dirinya terlebih dahulu ke http://www.tcd.uni-konstanz.de/plants_download/
- Terinstal PyMOL
- Terinstal custom shell scripts yang memungkinkan melakukan insilico analisis (prediksi aktivitas) suatu senyawa sebagai inhibitor enzim COX-2. Protokol yang digunakan merupakan luaran dan tervalidasi pada penelitian Yuniarti, et al. (2011). Hanya dengan diawali klik icon i-COX2 akan muncul antarmuka pengguna grafis untuk menggambar senyawa yang akan diprediksi dalam 2D (powered by BKChem). Setelah diekspor ke berkas .mol dengan nama test.mol, jendela BKChem ditutup dan secara otomatis custom shell scripts decision support system ini akan melanjutkan protokol dan memberikan luaran berupa informasi apakah senyawa tersebut diprediksi sebagai inhibitor COX-2 atau bukan. Jika diprediksi sebagai inhibitor COX-2 maka akan ada bonus berupa gambar tiga dimensi tumpang tindih senyawa dengan senyawa-senyawa referensi dan gambar 3D interaksi senyawa di sisi aktif COX-2 lengkap dengan ikatan hydrogen terhadap residu asam amino ARG513 (jika ada). Gambar-gambar tersebut sudah diatur sedemikian rupa sehingga siap untuk ditampilkan dalam publikasi ilmiah internasional.
Catatan: Harga pasaran USB 4GB terinstal OS Ubuntu adalah 14,5 Poundsterling (~ Rp 206.000,00; sumber info: http://shop.canonical.com/product_info.php?products_id=952). Dengan berinvestasi membeli insilico_COX-2_v1.0, maka Bapak/Ibu/Saudara sudah melakukan donasi sekitar Rp. 300.000 pada molmod.org (yang akan sangat bermanfaat dalam maintain sarana dan prasarana serta untuk melakukan penelitian lanjutan sehingga bisa mengeluarkan produk-produk lain yang bermanfaat) dan mendapatkan bonus custom shell scripts iCOX-2.
Pemesanan dan pertanyaan dapat via formulir di laman Kontak Kami atau via email ke enade[dot]istyastono[at]molmod.org.
